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强势来袭!基因测序“新贵”将深耕中国市场

2018-03-2939健康网
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核心提示:3月26日,Nanopore研讨会在上海召开,Oxford Nanopore 公司首席执行官戈登·桑格拉(Gordon Sanghera)、江苏先声医学诊断有限公司产品总监涂浩波、北京希望组生物科技有限公司CEO汪德鹏出席会议,并就当前基因测序技术进行了探讨。

  2008年,有公司曾预计,5年后,个人基因组的测序将在15分钟内完成,费用低于1000美元,人人都可以消费得起。这种说法当时被许多人认为是“不可能的任务”,然而,如今这个预言已经实现。

  326日,Nanopore研讨会在上海召开,OxfordNanopore公司首席执行官戈登·桑格拉(Gordon Sanghera)、江苏先声医学诊断有限公司产品总监涂浩波、北京希望组生物科技有限公司CEO汪德鹏出席会议,并就当前基因测序技术进行了探讨。

  “我们是全球唯一一家能够做到实时测量的公司,我们的目标是让任何人都能在任何环境下分析任何生物。未来,我们相信,牛津纳米的技术可以被广泛应用,除了用于寻找病毒种类,也可以被应用于农业及教育领域。”Gordon Sanghera在接受39健康网采访时表示,现在DNA测序仪设备在往便携式的方向发展,Oxford Nanopore公司(英国牛津纳米孔公司)一直在做的就是可以让用户花费很少的成本进行测序,并且任何人都可以使用公司的装置进行测序,此外,装置大小可以依据实验需求的变化而改变。

Oxford Nanopore公司首席执行官戈登·桑格拉(Gordon Sanghera

  便携、低成本!基因测序界杀出“黑马”

  基因测序仪是基因行业上游的核心,如同电脑中的CPU一样重要。近年来,随着基因测序产业飞速发展,新产品层出不穷,测序仪器也不断向小型化、智能化方向发展,纳米孔测序技术的出现,更是标志着测序技术未来的发展方向。

  据39健康网了解,纳米孔测序是国际上最受人关注的测序技术之一。其创新的电信号检测和单分子长链测序让全世界的科研工作者翘首以待。

  作为纳米孔技术的领跑者,Oxford Nanopore公司成功研发了世界上首例且唯一的纳米孔DNA/RNA测序仪,规避了第二代基因测序技术所面临的读长短以及无法解决高度杂合的基因组、高度重复序列、高GC区域、拷贝数变异、大的结构变异等缺陷。

  纳米孔测序的工作原理是将DNA的一条链通过纳米级的小孔(nanopore),与此同时,纳米孔上会通过离子电流,DNARNA的序列由核酸链依次通过小孔过程中电流的变化决定。不同于其他测序技术,Oxford Nanopore公司的技术不需要将基因组提前打断成数百万个几百个碱基长的片段,文库构建最快仅需十分钟,这使得即便使用手掌大小的测序仪也能够快速、经济地生产出长达上万个碱基的读长。使用纳米孔测序技术可以获得长度超过100万个碱基读长的序列,目前,纳米孔测序最长单条DNA序列长度超过130万个碱基。此外,该款测序仪还能够用于直接读取RNAcDNA序列,测通转录本的全长。

  实时、快速、简单、可拓展多重采样、直接分析、高质量共识数据,这些特征无不彰显出纳米孔测序的巨大潜力。

  涂浩波介绍,Oxford Nanopore这一技术平台相较于其他的测序平台有巨大的优势:第一,长度长,对于微生物鉴定有非常大的帮助;第二,可以实时检测、实时分析;第三,具有便携性,目前,世界上没有第二台这样便携性的仪器可在市场上使用。而利用这些优势,我们可以在临床医院做到床床检测,甚至是国家应急监控实时在现场鉴定疫情爆发的源头,进行实时地分析。

  “所有生物都有DNA,我们都会好奇是什么样的DNA,它是否在发生变化,是否健康。例如,现在就有某种病毒正在攻击非洲生长的某种农作物,他们就在实地使用我们的产品MinION协助预防及解决这个情况。所以,如果拥有实时DNA信息,那么就可以实现‘生物联网’(Internet of Living Things)。这与我们公司的远大愿景非常吻合:让任何人在任何地方都可以获取 DNA 信息。” Gordon Sanghera补充道。

  中国成基因测序最大市场

  作为医疗健康行业的火爆技术,基因测序近年来越来越得到临床的认可,并逐步被应用到各大领域中。而随着牛津纳米孔测序仪的产品需求日益增长,公司目前已经扩大其服务范围至全球70多个国家。而在Oxford Nanopore公司的服务供应商名单中也不乏中国本土企业的身影。

  作为Nanopore公司的参投企业和合作伙伴,先声药业早在2016年投资并引进了国际领先的ONT Nanopore纳米孔测序平台。先声药业集团下属的子公司先声诊断基于Nanopore纳米孔测序技术平台,经过大量自主研发,已建立起一套有效的病原体快速精准诊断和耐药分析方法,并且基于不同样本类型进行了相关方法学验证,取得了良好的阶段性成果。

  “先声制药是做药物研发的企业,药物的研发现在更多的是精准用药。它是两个方面,一是针对现有药物进行精准筛选找到更精准的病人;另外,利用基因测序技术,能够在新药研发过程中,在临床实验阶段去筛选合适的入组病人,去帮助更好地评估药效。在这一方面,Nanopore纳米孔测序平台可以通过技术开发,帮助先声集团的制药部分更好地开发更加适合于临床病患的新药,这也是我们的目标。”涂浩波强调。

39健康网了解,目前,先声诊断已经在国际上率先实现了利用Nanopore纳米孔测序平台对感染性心内膜炎病原体的宏基因组检测,以及对登革热病毒感染等临床样本的宏基因组检测。后续,先声诊断还将在Nanopore平台上开发针对复杂临床进行病原微生物鉴定和耐药分析的临床解决方案。

  2018117日,武汉未来组生物科技有限公司已通过Oxford Nanopore官方认证,获得Nanopore DNA测序认证服务供应商资质,属于中国首家,世界第一批。该公司现已面向中国和包括英国、美国在内的海外市场合作伙伴提供nanopore测序服务。除了能够提供纳米孔测序全系列的技术应用服务外,该公司在面对较复杂的样本如植物和昆虫时,也能得出令人满意的结果。

  汪德鹏先生表示:“我们发现Oxford Nanopore的优势非常明显,它的成本比二代测序更低,一台机器产生的数据比二代测序更多。这意味着三代测序可能在接下来的两三年成为主流的测序手段,所以我们毫不犹豫地朝这一方向努力。”

  这些案例无疑让Oxford Nanopore公司对在中国市场的发展更有信心。

  “目前全球共有12500个大型主机序列,自2015年以来,我们已经售出6000MinION产品,在接下来的6个月,我们预计会有1000-2000MinION销售到中国。1000美金的价格对于做DNA测序的人而言可以说是非常便宜。在看到中国的基因变革后,我们认为中国善于接受和拥抱创新和飞越性的技术,未来中国市场将是我们最大的基因测序市场。”Gordon Sanghera表示。(#画中画广告2#)

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