食品的卫生、安全主要是指人用食物物种的可食用性及食品本身没有被污染、没有质变现象，没有对人体有毒害作用的物质或可能导致生理病变等反应的物质和作用。
生态堡所产鲜食螺旋藻的卫生与安全性的基本原理及科学依据主要表现在以下几方面：
一、在物种方面：
螺旋藻是早就被世界卫生组织、联合国粮农组织、美国FDA等国际权威机构公认的“人类未来最佳营养食品”，中国卫生部也将其作为“营养新资源食品”。由此可以确认螺旋藻作为食品物种是安全可靠的。而生态堡所使用的藻种，更是由中国科学院武汉微藻研究中心从近百个品系中优选出的优质品系(纯顶螺旋藻)，无论从营养、品质、纯正度、抗变异以及生长性方面，均属最优良的品种之一。
二、在培养产出方式方面：
螺旋藻的发现利用，是因科学家发现生活在非洲乍得湖畔的土著人将湖中的蓝绿色物质捞取直接食用或在沙滩上晒干后食用，其体格强壮、极少生病，平均寿命在90岁以上，后经科学研究发现该食品是一种藻类，是十分适合人类食用的营养品，其形状为螺旋状，故称为螺旋藻。为了大规模地满足人类健康的需要，美、英等国先后开发了工业化生产螺旋藻的技术，后被世界广泛使用。而这种工业化的生产方式主要依靠开放式的水面养殖，这种养殖方法不仅受到季节变化的限制，同时，也不可避免地受到风沙、雨水及人为的污染。相对这种自然开放式的培养方法，生态堡采用的是几乎封闭培养的方式;使用的水为纯净水或自来水;生态堡制造所用的材料凡与培养物接触的部分，全都采用无毒材料，并已通过食品卫生检验合格;生态堡的扣齿防尘设计和净化后爆气翻腾溢氧设计，更杜绝了自然风沙、尘埃的侵入污染。因此，如果在此之前全世界使用开放式培养的螺旋藻食用尚属卫生的话，生态堡的封闭式加净化条件下的培养更不存在卫生方面的问题。
三、在培养基的安全性方面：
螺旋藻的生长除了需要水、阳光、空气外，还需要多种的基础生长元素如(碳源、氮源和多种矿物质)。以往工业化生产螺旋藻所使用的培养基一般都是工业级或农用级材料。生态堡所用的培养基即“鲜食螺旋藻专用培养源”，都是选用食用级(如碳源主要是食用小苏打、葡萄糖等)或分析纯级(其重金属等有害物质含量比工业级低几十倍到上千倍)，对于有些元素物质还进行了无毒害化处理。因此，由广西医科大学中心试验室在对生态堡鲜藻动物食用全面科学实验中，没有发现有毒有害、对动物产生致病、产生遗传不利影响的问题。北京市疾病预防控制中心随机抽样对鲜藻及培养源的重金属检验，其含量远远低于国家同类产品的规定标准。
四、PH值与渗透压：
在此之前，全世界基本都采用开放式培养生产螺旋藻，但污染致害问题并不多见。生态堡所产鲜藻及培养源送北京疾病预防控制中心检验时，其所含有害菌的数量之少让检验人员感到惊奇(生态堡鲜藻液菌总数不到国家规定的万分之一，大肠杆菌仅为干品的三十分之一，致病菌为零)，其中重要的原因与螺旋藻水生环境的两个重要指标有关：一是其PH值在9-11之间，这种高碱性的水环境，不要说自身不易产生细菌，即使有外来菌侵入也难以存活;二是培养液的渗透压远高于一般的水体，这是蓝藻生存所必须的(因螺旋藻在普通淡水中十几分钟其细胞壁便会自然破裂)，而改变培养液渗透压的物质，主要是食盐等无机盐类，这就进一步强化了其抗菌抑菌的作用力。
五、螺旋藻有无包涵、无内毒的生理特性：
螺旋藻是35亿年前的原始自养生物，在地球的亿万种生物圈内，像螺旋藻这样在如此长久、且生态环境多变的情况下，能仍然存在且无明显进化的物种十分罕见。这一奇特现象的原因到目前仍然是个谜。但是有一点是已被科学证实了的，那就是这种生物有一种难得的生理特性，即该生物不容易与其他生物有机体融合，在转化其无机物过程中，不易出现包涵体和内毒现象。这主要是因为这种自养生物因其处在生物链的最低层，其食物链也与其他生物不同，它只依靠水和无机元素通过光合作用分裂达到增殖。因此，一些制药业将人直接食用有毒或不易吸收的治疗性物质，经螺旋藻转化为无毒无害的有机质供人食用，便可达到食用安全、治疗效果更佳的目的就是很好的例证。
六、新鲜品与干品之区别：
螺旋藻属于水生植物，与其他植物一样含有很高的叶绿素A和叶绿素B，所不同的是，螺旋藻所含的蛋白质和维生素是其他任何植物所不可比的，因此营养极其丰富、齐全、配比均衡。从基本常识可以知道，富含叶绿素和维生素的果蔬类食品，新鲜的一定比干燥的或加工成罐头制品的更安全、更营养。而富含蛋白质的鱼、虾也一定是鲜活的比死亡后再加工的制品好。科学实验已证明，螺旋藻因其细胞壁极薄且营养丰富，采用以往的工业化加工(采集→烘干→制粉→压片或灌装胶囊→包装→储运→销售)消费方法，极易使螺旋藻品质受损和被加工过程污染(如在干品中叶绿素和氨基酸的含量比鲜品降低20%以上，抗氧化物歧化酶“SOD”鲜品中含量高达3750个国际单位，而在干藻中则全部灭活，其他生物活性物质也发生不同程度的变质或劣化现象，常见于螺旋藻干品中的腥臭味就是螺旋藻质变的外在反映)。而生态堡所产鲜活螺旋藻因可以使消费者做到即取即食(就像水果从树上摘下即食一样)，可有效避免螺旋藻的营养损失和质变问题。因此，食用生态堡所产的鲜活螺旋藻，只要遵循即采即食，冲淋充分(主要为清洗掉藻细胞外壁残留的培养液即碱味)，便能保证食用卫生、安全。
七、生态堡鲜藻培养过程中的科学护理与注意事项：
1、初次使用的生态堡，应用清洁的淡水(自来水即可)冲洗干净，再用少量热水冲洗消毒即可(但不要用抹布之类擦拭，以免污染或划伤)。
2、必须使用与生态堡匹配的“鲜食螺旋藻专用培养源”，因为这是按生态堡的特殊培养方式和所选用的藻种相匹配的且经过了无毒害化处理的专用培养基，不可使用来路不明或工业生产用的培养基，以免造成对螺旋藻生长的不利影响和对健康的危害。
3、配兑“培养液”的水最好使用合格的纯净水或蒸馏水(如有困难，可以凉开水代替)，这样不仅使螺旋藻长势好，观感好，而且培养液的消耗也会有所节省。
4、培养过程中一定要避免油、脂等有机物的污染。因螺旋藻是以无机质作为生长增殖的基本营养物的，不能吸收利用有机质，因此有机物特别是油脂类的物质，会对螺旋藻的生长起障碍作用，也容易导致有害菌类的借机入侵。因此，所有培养用具(包括堡体、配制培养液的容器、采集器、网、刷等)，都必须是清洁的。
5、螺旋藻在生长过程中会因其趋光特性，容易在光亮处黏附，长时间不采集或夏季气温过高(超过35℃)时较易产生老化藻，如出现结膜、结片或黄褐藻体时，应及时清理出生态堡，以免产生有机污染。
6、为确保生态堡产出的鲜活螺旋藻的品质和产量，用户一定要按时追加生态堡专用培养源。一次采集鲜活螺旋藻不可过量，以免影响螺旋藻分裂增殖。
